Borg Havn er et interkommunalt selskap (IKS), som eies av kommunene Sarpsborg, Fredrikstad og Hvaler. Morselskapet utgjør sammen med datterselskap og tilknyttede selskap (Borg Havn Eiendom AS/Habornveien 60, Borg CO2 og Borg CO2 Terminal) et konsern.
Selskapets vedtekter er en selskapsavtale som er forankret i de enkelte by- / kommunestyrer. Selskapsavtalen er utarbeidet i tråd med bestemmelser i lov om interkommunale selskap, og sier noe om selskapets formål, styrende organer og rammebetingelser.
Øverste organ i selskapet er representantskapet som består av tre medlemmer – ordførerne i deltakerkommunen med varaordførerne som personlig varamedlemmer. Representantskapet velger styremedlemmer, og det er opprettet en egen valgkomite som innstiller kandidater for representantskapet.
Funksjonstid for representantskapet er fire år og følger kommunevalgperioden. I henhold til Selskapsavtalen avholdes det eiermøte/representantskapsmøte i selskapet minimum to ganger årlig.
Representantskapet 2024-2028:
Magnus Arnesen, ordfører Sarpsborg (leder)
Mona Vauger, ordfører Hvaler (nestleder)
Arne Sekkelsten, ordfører Fredrikstad
Havnestyret 2022-2024:
Havnestyret 2022-2024 med vararepresentanter. Fra venstre: Harald Rønneberg, Mariann Karlsen, Terje Lyngaas, Kurt Allan Hansen, Trond Delbekk, Tore Lundestad (havnedirektør), Tina Bergstrøm, Jeanette Sælen Nicolaisen (sluttet, ny er Charlotte Iversen), Hilde Vatne Sørlie og Voica Imrik.
Havnestyret består av seks medlemmer og en vararepresentant som møter fast. Styret velges for en funksjonstid på to år, med mulighet til ytterligere to perioder (seks år).
Det avholdes cirka seks møter i året.
| Navn | Posisjon |
| Trond Delbekk | Styreleder |
| Mariann Karlsen | Nestleder |
| Harald Rønneberg | Styremedlem |
| Tina Bergstrøm | Styremedlem |
| Terje Lyngaas | Styremedlem |
| Charlotte Iversen | Styremedlem (ansatt representant) |
| Kurt Allan Hansen | 1. varamedlem (fast møtende) |
| Hilde Vatne Sørlie | 2. varamedlem |
| Voica Imrik | 3. varamedlem |
| Thomas Rein | Vara ansatt representant |
Borg Borg Havn IKS er eier og deleier i tre datterselskaper. Styresammensetningen er vist under:
Borg Havn Eiendom AS
Trond Delbekk (styreleder)
Mariann Karlsen
Terje Lyngaas
Borg CO2
Harald Rønneberg (styreleder)
Mariann Karlsen
Sean Martyn
Gianluca Di Federico Mangifesta
Pål Mikkelsen
Jannicke Bjerkås
Patrik Axelsson
Borg CO2 Terminal AS
Harald Rønneberg (styreleder)
Mariann Karlsen
Rolf Egil De Flon
Terje Lyngaas
